水利与土木工程结构实验中心总建筑面积约1.5万平方米，主要进行岩土与混凝土材料基本性能，材料构件、结构及整体模型的静动态性能等试验研究。已建成反力墙及拟动力混合试验系统、大型高压土工材料试验平台、3000吨级压剪试验系统、移动式多点加载系统等多台套大型仪器设备。

      水利与土木工程结构实验中心建设有国内外技术性能领先的三向六自由度模拟地震水下振动台系统，主要由直径5.75米的圆形台体、液压油源、作动器、控制系统、台上水池等组成，系统具有设备防水、工作频带宽、满载加速度大等三大特点。系统建设期间，解决了防水问题、水池输排水系统及应急排水、基坑风箱效应、基础隔振、水池池壁消波等关键技术难题。主要服务于各类水工建筑物、桥梁、隧道、海上风电基础等结构模型的抗震试验研究。

      河海大学高性能计算平台是学校教学科研支撑服务平台，2003年利用通用服务器自主搭建了第一套高性能计算集群，在江苏省高校率先开展面向全校师生的高性能计算服务；2011年加入中国教育科研网格（ChinaGrid）二期建设，成为力学重点学科云；2019年开展高性能计算资源整合，集中场地统一建设，成立校级高性能计算公共平台；2023年完成河海大学高性能计算公共平台项目超2万核的计算资源和配套环境建设。

      以CPU和GPU异构超算平台的全面构架，满足各学科领域对于大规模数据处理和大规模科学计算的普遍需求，同时为聚焦水利、环境、土木等优势学科，协同新兴学科、交叉学科建设提供强大数字底座，助力高质量人才培养和高水平科学研究。

      港口航道工程与海岸科学实验中心由11个实验室组成，包括航道实验室、环境泥沙实验室、海洋环境实验室、海工实验室、河口海岸实验室、港航动力实验室、港航结构实验室、海洋调查实验室、仪器管理和研发中心、计算中心、数据中心，总占地面积约为12000 m2。

      目前拥有风浪流实验水槽、综合性实验港池及测控设备、环境泥沙实验设备、开边界多泵控制潮流模拟系统、本科教学实验平台、海工结构防腐实验平台、海洋调查设备、野外观测站、高性能计算集群等。

      水灾害防御全国重点实验室前身是水文水资源与水利工程科学国家重点实验室，实验室于2005年3月经科技部批准，依托河海大学和南京水利科学研究院共同建设，2007年6月通过验收。2013年、2018年连续评为优秀类国家重点实验室。2023年3月，国家科技部正式批准通过实验室重组为水灾害防御全国重点实验室。

      现任学术委员会主任张建云院士，实验室主任鲁春辉教授。实验室围绕水利领域国家重大需求，整合优势资源，汇聚高层次人才，聚焦水灾害防御领域应用基础研究，攻克重大工程关键技术难题，打造我国水灾害防御“支撑有力、前沿领先、根基深厚的国家战略科技支撑力量”。

      地球科学与工程实验中心是地质工程、测绘工程、地理信息系统及全校二十多个工科专业进行实验教学、创新创业训练、科学研究和技术研发的重要基地。实验中心下设地质工程实验室、测绘工程实验室两个专业实验室，总面积4050平方米，设备资产总值2620余万元。现有全职人员11人，含专职实验人员10人，其中高级实验师6人，实验师4人。

      实验中心自成立以来，充分发挥各种资源优势，不断进行实验教学理念与改革思路的探索，在重视学生实验基本技能的基础上，注重创新性、开放性、设计性、综合性实验的开展，实施“产、学、研”相结合的实验教学模式，紧密结合生产实际和科研项目，强化学生综合性和创新性实验能力的训练，为培养复合型高层次人才打下坚实基础。

      实验中心注重学科交叉、原始创新与高新技术应用，在完成实验教学任务的同时，利用仪器设备优势，承担生产科研任务，项目涉及水利、交通、能源、工民建等广泛领域，为解决国家重大工程面临的地球科学问题做出重要贡献。

      海洋科学实验中心，2018年秋挂牌并投入运行，坐落于河海大学西康路校区篮球场北侧，主楼建筑面积约2200平方米，承担河海大学海洋学院广大师生的实验教学及科研任务。

      实验中心下设有海洋生物学实验室、海洋生态学实验室、海洋微生物实验室、生物化学实验室、普通遗传学实验室、细胞生物学实验室、分子生物学实验室、岩矿标本实验室、偏光显微镜实验室和网络机房九个本科教学平台；以及海洋生态环境实验室、海洋环境毒理实验室、海洋生物技术实验室、海洋生物资源利用实验室、海洋地质科学实验室、海洋环境遥感卫星地面接收站等多个科研平台系统。拥有温盐深剖面仪、声学多普勒海流剖面仪、多功能微尺度湍流剖面仪、走航式水体表观光谱观测系统、热场发射扫描电镜、构造地质学与海底构造实验仪器、荧光倒置显微镜、全波长多功能酶标仪、多功能叶绿素荧光仪、营养盐分析仪、傅里叶显微红外光谱仪、全自动微生物鉴定及药敏分析系统等观测、实验仪器设备600余台。以上仪器设备和实验室可以满足物理海洋学、海洋生物学和海洋地质的日常教学和科研需求。